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基于KASP技术的SNP 基因型检测服务
2019-03-17 文章来源:市场部 浏览量:846 分享到:


KASP 即竞争性等位基因特异性PCR(Kompetitive Allele Specific PCR),可在广泛的基因组DNA 样品中(甚至是一些复杂基因组的DNA 样品),对SNPs 和特定位点上的InDels 进行精准的双等位基因判断。KASP方法的技术核心是用2个荧光探针、2个通用淬灭探针,再加多个位点特异探针来检则多个SNP位点,这项技术是基于引物末端碱基的特异匹配来对SNP分型以及检测InDels (Insertions and Deletions,插入和缺失)。原理上类似Taqman检测,也是基于终端荧光读取判断,每孔采用双色荧光检测一个样本的一个位点可能的两种基因型,而KASP技术与Taqman技术不同的是,它不需要每个SNP位点都去合成特异的荧光引物,它基于自己独特的ARM PCR原理,让所有的位点检测最终都使用通用荧光引物扩增,这大大降低了LGC KASP的试剂成本,既有金标准的准确,又降低了使用成本,比Taqman还具有更好的位点适应性,所以在医学、农学检测方面KASP都有非常好的应用。


维百奥生物(北京)生物科技有限公司为广大客户提供基于KASP技术的SNP分型服务。


(一)样品要求、服务周期和应用范围:

1. 请提供血液、组织或DNA样品,及准确的基因名称(基因ID)、序列和详细的SNP位点信息。 

2. 血液:样品需用EDTA抗凝,总量大于1 ml,采集后于-20℃或-80℃保存。 

3. 组织:样品可为新鲜组织(最好保存于-80℃)、石蜡包埋的组织或95%乙醇中固定的组织,总量≥10mg。样品-70℃邮寄至本公司(干冰或液氮运送)以保证样品质量。

4. 基因组DNA:浓度≥20ng/μl,总体积≥20μl。所需样品量根据实验要求做相应调整。

5. PCR产物:达到实验要求的PCR产物,浓度≥50ng/μl,总体积≥20μl。

6. 检查周期: 10-15 个工作日

7. 检测平台: LGC® SNPline 基因型分型技术平台、Douglas Array Tape 平台

8. 真实性检测、基因精细定位、分子标记辅助育种、种质资源分析等


(二)技术路线:

图片1.png

(三)结果展示:

结果示例针对SNP位点(A/G)设计KASP引物,对30个材料进行KASP分型验证,结果如图所示。红色:纯合类型1(野生型),基因型为A:A;蓝色:纯合类型2(纯合突变体),基因型为G:G;绿色:杂合类型(杂合突变体),基因型为G:A。

 图片2.png



 

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